三密者，身語意三密也。
　　一、身密　如手結印契是也。
　　二、語密　如密誦真言是也。
　　三、意密　如住瑜伽相應，白淨月滿，觀菩提心是也。
　　凡夫與大日如來，共以六大為體，四曼為相，本無差別。良由凡夫迷之，如來悟之，致有差別耳。如行持三密，一如大日如來。則大日如來之光，映於持者之心水。持者之心水，亦受持大日如來之光。是謂行者三密三應，而受如來三密加持矣。
　　今分為如來自證之三密，與眾生修行之三密而辨之。如來三密者，身語意之三業，本來平等，身等於語，語等於意，皆遍法界，謂為法佛平等之三密。然則一切之形色為身密，一切之音聲為語密，一切之理為意密也。而謂之為密者，非秘隱於人之謂，乃以此等之義，為法佛自證之境，無凡人之分，故謂之密。又吾等於一切平等，雖本來具之，然以惑染隱秘之故，謂之密也。顯教雖於密跡力士經說佛之三密，不可思議，然未顯一一之三業所作，盡法性之至理。又凡夫為印言觀想，即與如來之三密，同備無盡之德用。又依三密之加持力，自他同有滅罪障禳災疫除病患等無量之不思議，均未說也。密教則頗能說其真實之相。
　　修行三密吾等既具法佛之三密，然為惑染而不能證得之故，以佛之大悲心，使眾生行生佛平等之三密。身結印契為身密，口誦真言為語密，意觀其種子，或觀其三昧耶形，成觀其本尊，是為意密。行此三密，則為如來之三密所加持。眾生之三業，與如來之三密，入我我入，無二無別，謂之三密相應，依三密相應，成就一切之悉地也。菩提心論曰：‘凡修習瑜伽觀行人，當須具修三密行，證悟五相成身義也。’大日經疏曰：‘入真言門，略有三事：一者身密門，二者語密門，三者心密門。行者以此三方便，自淨三業，即為如來三密之所加持。乃至能於此身，滿足地波羅密，不復經歷劫數，備修諸對治行。又然毗盧遮那內證之德，以加持故，從一一智印，各現執金剛神形色性類，皆有表象，各隨本緣性慾，引攝眾生。若諸行人，慇勤修習，能令三業，同於本尊，從此一門，得入法界。然是為對劣機之方便，非為至極，以無相之三密為至極也。’大日經供養法曰：‘甚深無相法，劣慧所不堪，為應彼等故，兼說有相法。’要略念誦經曰：‘相無相甚深，少智不能入，依無相說相，攝彼二種人。’
　　‘三密瑜伽’　總名真言之行法也，以真言之行法，欲得三密之瑜伽故也。瑜伽者相應之義，身結印口唱咒意觀理，此三事相應。又眾生之三業，與佛之三密，入我我入，彼此平等，謂之瑜伽。依此瑜伽，成就所求之事。眾生身語意之三密，與法身佛之三密，相應融和而無隔歷，父母所生之肉身，即為佛身也。