1.貪慾蓋：指貪愛五欲妙境，能使眾生心性迷惑，令善法永不生起。

2.瞋恚蓋：指瞋恚能令人於違情的境上生起怨恨，因為憤怒相續，而蓋覆我們清淨的心性。

3.惛眠蓋：又稱睡眠蓋，全稱「惛沉睡眠蓋」。指惛沈和睡眠令心性昏沉暗塞，而忘失正念。因為二者都是以暗昧為性，所以併列為一蓋。《修習止觀坐禪法要》說：這種睡眠蓋最為嚴重，因為「諸餘蓋情覺故可除，睡眠如死，無所覺識，以不覺故，難可除滅。」因此，學道者應憤發精進，去除惛眠的習性。

4.掉舉惡作蓋：掉舉，指心躁動不安，是「惛沈」的對稱。惡作，與悔同義。惡，是厭惡；作，是所作。惡所蓋，是憂悔厭惡過去所作的事，能障禪定。兩者都是因為想到親屬、國土、不死，以及憶念往事而生起，所以合併為一蓋。

初學佛者，因為過去躁動的習氣一時難消，在習禪修定的時候，就會妄想紛飛，因此坐立不安，當雜念好不容易消除了，定下心來，又開始憶想往事，產生種種追悔，如果悔箭入心過深，就會使心神不寧，覆障修道。因此，掉舉惡作是修道者應力求泯除的習氣。

5.疑蓋：對於佛法真理猶豫不決，因而覆蓋清淨的心性。疑對於修道障礙之深，可以從經中的譬喻看出：

(1)疑如刺：疑惑危害善根，猶如毒刺一樣，能夠傷人。

(2)疑如根：疑惑深入心中，好比老樹的根深植於地，根深蒂固，盤根錯結，不易拔除。

(3)疑如網：疑惑之情交織，有如大網一樣，罩住信心，覆蓋正法，牽絆眾生，使不得出離。

經云：「佛法大海，唯信能入。」「信為道源功德母。」疑能覆蓋清淨心性，使我們退失信願，無法趨入正法，依之修行。所以，修行要趣，首先必須對佛陀的聖言量斷疑生信。