胎藏院曼荼羅，為胎藏界之諸尊。如其位安置於壇場者，壇中安置十三大院、四百十四尊，一切之功德，輪圓具足者，是胎藏界之曼荼羅也。此曼荼羅，乃顯眾生本具之理性者，故又名因曼荼羅，理曼荼羅。以東方為發因之位，故亦名東曼荼羅。其理性清淨無垢之德，喻之蓮華，故亦名蓮華曼荼羅。又此曼荼羅，有現圖曼荼羅與阿闍梨所傳曼荼羅之二種：現圖曼荼羅為圖畫，善無畏三藏祈請虛空炳現之壇形，即現今流布於世者是也。阿闍梨所傳曼荼羅，為大日經及儀軌所說，不載之於圖畫，由一一阿闍梨傳其作法及義理。二者相違之點不少，蓋現圖為結緣，阿闍梨所傳為傳法也。
　　‘十三大院’　大日經儀軌說胎藏曼荼羅畫十三大院而安置諸尊，但現圖曼荼羅缺四大護院之一，而為十二大院。
　　‘四百十四尊’　諸家所說之數無定，而以四百十四尊為常數。第一、中台八葉院九尊。第二、遍知院七尊。第三、釋迦院三十九尊。第四、持明院五尊。第五、虛空藏院二十八尊。第六、金剛手院三十三尊。第七、除蓋障院九尊。第八、觀音院三十七尊。第九、地藏院九尊。第十、文殊院二十五尊。第十一、蘇悉地院八尊。已上二百九尊，謂之內院。第十二、外周之金剛院二百五尊，通內外院為四百十四尊也。
　　‘胎藏界五佛’　胎藏界曼陀羅之中心部，雲中胎藏，又稱中台八葉院，八葉蓮華開敷之形也。中台是大日如來，四方之四葉，現四佛；四維之四葉，現四菩薩；即南方開敷華王如來，東方寶幢如來，北方天鼓雷音如來，西方無量壽如來，中台之大日如來，合為五佛也。
　　‘胎藏界九尊’　中台八葉院之九尊也。前之五佛，加東南維普賢菩薩，西南維文殊菩薩，東北維彌勒菩薩，西北維觀音菩薩之四尊也。